香港工貿署將會成立一個CEPA專責單位，以解答廠商落實CEPA時所遇到的疑問，工商及科技局表示，專責單位除了印制有關資料予廠商，又會同時成立網頁、熱線服務，透過不同途徑向廠商提供有用資訊及回應一般查詢。對於其他不同的諮詢，新部門亦會儘快作出回應。

公布的附件會列明，至少有一半貨品要在香港完成30%附加值，才可享受惠零關稅。一直被看為CEPA大贏家的鐘錶及珠寶業均指出，反對以30%附加值做界定香港產品的準則。香港錶廠商會透露，由於入口的錶芯佔整體成本50%，有會員已暫停將生產線搬回香港，除非未來大陸允許用特定工序去取代附加值。

香港工商及科技局表示或許首輪談判結果令部分行業不滿意，但重申CEPA內容可不斷更新，若之後有其他要求是目前仍未達到的，無論是貨物及服務貿易方面，當局會繼續反映、討論，亦有機制處理之後的要求。

另外，該局將公布的附件會清楚地列出實施的步驟，當局也會組織一些研討會或會議，向廠家解釋措施的詳細條例。